圣武殿上，林启荣宣读完整编章程之后，萧云贵缓缓站起身说道：“通过这次整编，还要裁汰一批老弱之兵，裁汰下来的一部分有资质的可以留任讲武学堂，一部分配到刑部警察司充任地方警察，还有一部分分流到乡兵司。【】整个西殿兵马本王希望通过整编能保持在三个军九个师十三万人之内。”
听到军队要缩编，在座的将军们没有出声，反倒是王闿运有些不解的问道：“西王殿下，将人马缩减到十三万，将来咱们还要打苏北、福建，江西那边也还需要增兵，会不会兵力太少了？”
萧云贵微微颔首道：“壬秋精于政务，可能不清楚军中之事，这次整编之后，西殿兵马每一个将士都要用上火枪，西殿兵马将变成热兵器军队。热兵器军队和冷兵器军队不同，热兵器军队更加看重后勤保障，而不是像冷兵器部队那样注重人数优势。所以我西殿要养十三万之巨的热兵器部队，正所谓大炮一响、黄金万两，今后咱们西殿兵马作战，那银钱就跟流水一般花出去。要不是本王占了苏褔省这富庶之地，还和洋人做着生意、收着关税，本王也不敢想养这么多的火枪兵马的。况且清妖的兵力也不怎么充裕，十三万兵马眼下也够用，等打下福建、广东、江西等地再扩充兵马也不迟。而这十三万兵马整编之后，便是西殿攻城略地的野战之军，至于今后地方上的治安、防务，除了险要之地外，各大郡县本王不打算派驻太多的野战兵马，地方防务和治安交给乡兵和警察便可，如此就不会占用太多的精锐兵马守城。十三万兵马，盘算、盘算还是够用了。”
王闿运明白过来。当下点点头道：“西王所虑甚是。”
萧云贵站着轻轻敲了敲桌案环视众将一眼道：“还有不清楚的吗？”
众将异口同声的道：“没有！”
萧云贵满意的点点头沉声说道：“这次整编关乎未来西殿大军武运，甚至关乎天国国运。整编章程即是军法，本王坐镇上海，看着各部整编，左相和李开芳坐镇苏州策应，各部接令后即行。但有拖延时日着，按军法从事，本王不管他是谁，也不管他从前立过多大的功劳，但犯我军法者，一律从严惩处！绝不姑息！”
西王的威严和决心让在座的将领都是心中一凛，一起站起身来。齐刷刷的敬了个大声道：“保证完成任务！”
会后萧云贵和各兵科、司部的中外教官、学员都一一单独见面详谈，对各兵科、司部提出了一些新的建议和要求，同时也算认识了一下讲武学堂内的人。
当天下午第一批驻守上海的林启荣部太平军便开到了讲武学堂外扎营，其余地方抽调的整编部队也都在未来三天内陆续到达。
随后便开始了为期三个月的整训和重新编组。新编第一师仍由林启荣指挥，新编第二师则由周立春指挥。潘启亮、陈阿林、黄威、黄德美等小刀会、青浦义军将领则充任新编师的旅长、团长等职位。林启荣部下太平军将领如陈知命、李天熙等也出任新编师的旅长、团长等职。
整编章程还附粘了整编后军队的新称谓和新军衔制，和后世一样。普通士兵分为列兵、一等至三等兵四个军衔，士官分为上中下三级，尉官分为上中少三级，校官也分为上中少三级，将领分为准将、上中少三级，最上面是大元帅。
萧云贵当仁不让的自加了一个西殿大元帅的名号，加个大元帅的名号不算什么。他那长得不能再长的封号里经过天京方面的文饰和加上的大元帅头衔已经变成：传救世主天兄基督太子圣旨圣神上帝之雨电右弼又正军师西殿大元帅顶天扶朝纲西王萧朝贵。
其余将士们也没有太过在意这个军衔，萧云贵也没有废除天京方面还在用的检点、监军等名称，虽然在西殿官吏中，天国这些旧时的官爵早已经被萧云贵变成了虚衔，但萧云贵还是没有废除它，毕竟西殿的官还是要向天京报备的，没有这些虚衔还是很麻烦，而且天京那边也不明白一个少校是多大的官啊。
与天国旧时虚衔官爵不同，西殿这套军衔却是实打实的好处，按照不同的军衔，你享受到的待遇也是不一样的。天京那边因为开始扩张、扩兵的缘故，天王、东王等王爷们为了笼络人心，那官爵也是大加派送，如今在天京可谓是检点满地是，监军不如狗。联想到后期天国一口气居然封了两千七百多个王爷，那就更加可怕了。
所以萧云贵在没有废除天国旧官爵的前提下，把新军衔当成实衔来封赏给将士们，并根据新军衔来定将士们的军功和待遇。如今是战乱年代，战功涨得很快，这也就意味着军人升职的机会很多。从前西殿也出现过尴尬的事，就是将士们的战功很大，个个升职都很快，而天国旧爵从低等的圣兵开始到可以领数百兵的旅帅不过四个级别，也就意味着打几个大胜仗下来，一大批将士升职之后，一支兵马中将官很多，而兵卒很少。也曾经出现一旅之内士兵只有不足百人，两司马以上的将官却有三百多人。
这种局面会让将士们觉得这官爵来得容易，久而久之便不太珍惜了。而新的军衔制就不同了，光士兵的等级就有四个级别，熬到一等兵需要立多少军功也是有明文规定的，而就算你熬到一等兵却也还是一名士兵，要升上士官就更加不容易了。这就让西殿太平军的军制更加趋于合理，而不是像从前那样封到后面无官可封搞出几千个王爷来。
除了军衔制外，兵部还修订了《苏褔省征兵制》，明确了西殿是征兵制和募兵制并轨实行的。这次经过整编之后的将士都算是募兵制下的常备职业军人，经后西殿野战军就是一支职业军人组成的军队，他们的薪俸、粮饷都是西王府提供，也就意味着他们成了西殿的兵马，这也打破了圣库供养的情况，士兵们也可以有私产了。
而征兵制则是针对乡兵制定的，乡间村坊的青壮凡是年满十八岁后，就有加入地方乡兵部队服役三年的义务，三年后退伍，回地方务农。但每地的乡兵都有一个限额，也不一定所有十八岁的青壮都能当上乡兵。
萧云贵之所以选择募兵制和征兵制并行，是因为现在太平军还没有取得天下，而且列强还在虎视眈眈，他需要常备军队来作战。虽然募兵制将来可能成为国家沉重的负担，但萧云贵相信等到取得天下，列强的威胁也降低的时候，再改为征兵制，这样就不会有什么大问题了。
此外西殿兵部还颁布了《伤残捐躯将士照养章程》，西殿将士们伤残之后，西王府也是一样的照养，同时会安排伤残将士就业。捐躯的将士除了得到抚恤金之外，西王府还能分家属二十亩土地。这些都是职业兵能享受的待遇，而乡兵因为是义务兵，能享受的待遇就差了一些，但伤残捐躯之后也同样有保障。
最后就是兵部颁布的《西殿荣誉爵位章程》，这个章程里规定的则是爵位和一些荣誉称号和荣誉勋章的种类，以及获得勋章后可以享受到的待遇。爵位萧云贵依然采用了公侯伯子男五等爵位来奖励有功之人。称号当中有羽林卫、禁卫军、虎贲烈士等等军事性的荣誉称号，也有太师、太傅、太保、上卿、少卿等文事性的荣誉称号。勋章则是以汉家一些著名人物为名的勋章，如霍去病勋章、岳武穆勋章等等军事性勋章，也有如班超勋章、张良勋章等等文事性勋章。值得一提的是各行各业都有勋章，这些勋章是用来表彰各行各业涌现出来的人才，反正古代汉家各行各业有的是名人，直接用名人命名勋章即可。比如工匠们的勋章叫鲁班勋章，大夫们的勋章叫扁鹊勋章等等。
爵位和荣誉称号一旦获得，按照等级西王府会每年给予奖金或者其他免税政策，而勋章获得则是一次性奖励一笔钱财。这个手段更加丰富了奖赏功劳的手段，不像之前太平军中人人都是在圣库吃大锅饭，有功劳了大家都加官进爵，手段比较单一。这个章程颁行之后不但刺激了军队的荣誉感，也大大刺激了各行百业人等的上进之心，历朝历代何时明文规定会奖励辛苦的工匠、大夫等三教九流的人物？
此令颁行之后，萧云贵也直接便用，封赏了一批能臣旧将，不少跟随萧云贵的老将们被封为子爵、男爵不等，荣誉称号也是发了一批，萧云贵更加许诺，整编结束后，有突出功绩的会颁给第一批的勋章，萧云贵为了尽快完成整编，不介意下一阵勋章雨。
萧云贵选在这个时候颁布各种和军队有关的保障条令，也是本着打一个嘴巴，安抚一下的原则。让军队看到整编后可以拿到的好处，同时也用爵位安抚了一大批能臣旧将，让整编之事能更加顺利的进行下去。
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